Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD1Q16881 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms