Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2Q16621 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms