Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZFHX3Q15911 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZFHX3Q15911 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZFHX3Q15911 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZFHX3Q15911 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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