Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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IFT88Q13099 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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IFT88Q13099 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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