Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms