Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms