Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP6P55212 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP6P55212 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP6P55212 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP6P55212 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP6P55212 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP6P55212 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP6P55212 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms