Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCCP43146 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCCP43146 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCCP43146 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCCP43146 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCCP43146 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCCP43146 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCCP43146 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCCP43146 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCCP43146 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms