Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms