Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676.9 ms