Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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