Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCH6O60337 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARCH6O60337 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms