Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms