Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRTO14522 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRTO14522 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRTO14522 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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