Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms