Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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