Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPROQ16827 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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