Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ME3Q16798 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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ME3Q16798 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ME3Q16798 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ME3Q16798 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ME3Q16798 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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