Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
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HERC1Q15751 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
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HERC1Q15751 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
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