Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A3Q14050 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms