Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms