| NAE1 | Q13564 | RNU6-1227P-201 | ENST00000383981 | 107 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD14D-201 | ENST00000384390 | 87 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC020594.1-201 | ENST00000437680 | 338 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4435-2HG-213 | ENST00000451884 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | HMGN2P9-201 | ENST00000476875 | 229 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | CFAP100-207 | ENST00000510833 | 481 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC087441.2-201 | ENST00000529141 | 262 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL442163.3-201 | ENST00000554110 | 156 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC126323.6-201 | ENST00000561701 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR5188-201 | ENST00000583467 | 113 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR3171-201 | ENST00000584270 | 74 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | TTC6-201 | ENST00000267368 | 1681 nt | TSL 5 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIPOL1-203 | ENST00000537471 | 5954 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC005336.3-201 | ENST00000623833 | 2679 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR340-201 | ENST00000362125 | 95 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.80-201 | ENST00000362996 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD87-201 | ENST00000364849 | 89 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.415-201 | ENST00000384012 | 112 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.485-201 | ENST00000384395 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.500-201 | ENST00000384466 | 111 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR628-201 | ENST00000385229 | 95 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1302-11-201 | ENST00000408051 | 138 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD23.1-201 | ENST00000408212 | 104 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1302-9-201 | ENST00000408365 | 138 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1302-10-201 | ENST00000408734 | 138 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC005534.2-201 | ENST00000431047 | 433 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC110995.1-201 | ENST00000444185 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC008413.1-201 | ENST00000511864 | 177 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC023442.1-201 | ENST00000531247 | 422 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AK6P2-201 | ENST00000549020 | 471 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4753-201 | ENST00000585119 | 83 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1302-2-201 | ENST00000607096 | 138 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL357075.2-201 | ENST00000614906 | 189 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | TTK-202 | ENST00000369798 | 3010 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLITRK6-201 | ENST00000400286 | 4318 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | VPS13A-206 | ENST00000376646 | 2262 nt | TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MARCH7-203 | ENST00000409591 | 2147 nt | TSL 2 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MRPL42-202 | ENST00000393128 | 1983 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.148-201 | ENST00000363557 | 117 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.216-201 | ENST00000364205 | 93 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1164P-201 | ENST00000364428 | 107 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA22B-201 | ENST00000383876 | 138 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | NPS-201 | ENST00000398023 | 270 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.595-201 | ENST00000410403 | 105 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC00448-201 | ENST00000438352 | 402 nt | TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010531.2-201 | ENST00000465012 | 153 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL163540.1-201 | ENST00000485382 | 386 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-475P-201 | ENST00000516073 | 104 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA40.14-201 | ENST00000516543 | 86 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | CYCSP23-201 | ENST00000519781 | 313 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL078596.1-201 | ENST00000624856 | 447 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-708P-201 | ENST00000384217 | 107 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-975P-201 | ENST00000384296 | 105 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP270-201 | ENST00000411361 | 118 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCO3P19-201 | ENST00000415864 | 321 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | FO680682.1-201 | ENST00000421261 | 345 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL162400.2-201 | ENST00000427547 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL160004.2-201 | ENST00000432935 | 350 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL590422.1-201 | ENST00000451829 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | PCNPP5-201 | ENST00000452246 | 481 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC114982.1-201 | ENST00000469402 | 321 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC104435.1-201 | ENST00000483483 | 166 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA25.10-201 | ENST00000515926 | 124 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP200-201 | ENST00000516360 | 103 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-988P-201 | ENST00000519081 | 107 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC087664.2-201 | ENST00000522898 | 551 nt | TSL 4 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC107886.1-201 | ENST00000526935 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | GNAI2P1-201 | ENST00000541815 | 315 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC087463.2-201 | ENST00000565943 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD53-201 | ENST00000579969 | 78 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL356055.1-201 | ENST00000602528 | 446 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | DSCR8-208 | ENST00000614538 | 403 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | PRKD3-201 | ENST00000234179 | 5900 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | HAS2-201 | ENST00000303924 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | PTPRQ-208 | ENST00000614701 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| NAE1 | Q13564 | PYGO1-201 | ENST00000302000 | 8488 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |