Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXE3Q13461 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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