Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms