Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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