Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRDNQ13061 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRDNQ13061 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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