Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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