Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BNIP3Q12983 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
BNIP3Q12983 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
BNIP3Q12983 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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