Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPEQ02224 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms