Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LONRF1Q17RB8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LONRF1Q17RB8 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LONRF1Q17RB8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LONRF1Q17RB8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LONRF1Q17RB8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LONRF1Q17RB8 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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