Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK4Q16099 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1703.4 ms