Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC85BQ15834 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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