Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TAF1AQ15573 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms