Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ODF1Q14990 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ODF1Q14990 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ODF1Q14990 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ODF1Q14990 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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