Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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CKAP5Q14008 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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