Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NCOA4Q13772 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NCOA4Q13772 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms