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| FHL3 | Q13643 | MARCH7-203 | ENST00000409591 | 2147 nt | TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | ERBIN-204 | ENST00000380943 | 6410 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | ATF1-201 | ENST00000262053 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC02386-203 | ENST00000552182 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FHL3 | Q13643 | U2.14-201 | ENST00000615943 | 113 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR376A1-201 | ENST00000616574 | 68 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC008873.1-201 | ENST00000625051 | 138 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF280C-201 | ENST00000370978 | 4634 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | SKIL-203 | ENST00000426052 | 2757 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC008264.2-201 | ENST00000610193 | 3731 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | ANKRD30BP1-201 | ENST00000451052 | 2186 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1290P-201 | ENST00000362957 | 109 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.111-201 | ENST00000363248 | 100 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP125-201 | ENST00000364843 | 120 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL079342.1-201 | ENST00000401460 | 267 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-651P-201 | ENST00000411040 | 105 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FHL3 | Q13643 | TOMM22P2-201 | ENST00000430735 | 237 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | HSPE1P25-201 | ENST00000455484 | 251 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | COX6CP14-201 | ENST00000469580 | 174 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC117440.1-201 | ENST00000474107 | 571 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FHL3 | Q13643 | SEPT14P8-201 | ENST00000508026 | 178 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |