Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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FHL3Q13643 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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