Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NEUROD1Q13562 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEUROD1Q13562 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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