Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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