Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRIM28Q13263 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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