Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSTF3Q12996 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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