Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTPAP49638 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTPAP49638 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTPAP49638 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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