Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms