Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PITRM1Q5JRX3 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms