Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FXNQ16595 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FXNQ16595 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FXNQ16595 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FXNQ16595 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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FXNQ16595 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FXNQ16595 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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