Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NPTX1Q15818 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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