Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGN3Q15651 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms