Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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