Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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PDE6HQ13956 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
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PDE6HQ13956 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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PDE6HQ13956 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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PDE6HQ13956 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PDE6HQ13956 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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