Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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CUL3Q13618 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL3Q13618 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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