Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SP140Q13342 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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SP140Q13342 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SP140Q13342 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SP140Q13342 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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